回到木叶后，寿树开始安静了下来，每天去木叶医院转一下，解决一下疑难杂症，然后时不时去给漩涡鸣人做些培训。
几天后纲手带队回到了村子里，立刻召集层人员开会。
寿树坐在会场里安静的当个小透明听着纲手讲五影大会中与其它村子达成的协议。
木叶的一支忍者部队已经在纲手回村之前就出发前往雨之国了。
寿树也接到了纲手的调令，带领着他的那队特殊小队组成九尾人柱力保护小组，从现在开始时刻不离的保护旋涡鸣人的安全。
宇智波光、大筒木舍人和辉夜君麻吕都已经在木叶亮相很久了。
日向一族在用了各种办法都没能奈何舍人之后，族内矛盾越加激烈，加上宇智波一族的事，也开始酝酿内乱了。
君麻吕则作为尸骨脉血继的唯一传人，很受一些忍者家族的欢迎，纷纷派女忍者和其接触，想要招赘他。
很快五大忍村联合部队就在雨之国与雨忍展开了激烈的战斗，雨忍完全不敌五大忍村联手，很快就退回了雨忍村进行坚守。
五大忍村的忍者部队包围了雨忍村，在经过几天的试探和渗透后，联合部队攻入了雨忍村，但没有发现晓组织所在。
晓组织早在战争之前就提前转移了，虽然小南异常反对，但在长门被‘宇智波斑’和绝说服之后，也无能为力。
晓组织暂时消失在了五大忍村的视野之中。
这时关于龙地洞被灭的消息也传遍了忍界，作为三大圣地之一，其竟然悄无声息的就湮灭了，让所有知道的人都异常惊讶。
妙木山反应最为激烈，除了自来也，常年不在忍界出现的蛤蟆也出现了不少在调查龙地洞的事情。
一晃眼几个月过去了，鸣人和佐助他们也迎来了毕业考试，考试合格之后，他们就是光荣的一名木叶下忍了。
鸣人感到异常兴奋，跟着寿树大哥学习了几个月的时间，他认为自己已经远远超过一般下忍了，这次考试他准备目标是考个第一名。
宇智波佐助则压力很大，宇智波一族现在已经事实上分裂成两部分了，宇智波富岳与宇智波鼬分别成为了两只宇智波的首领，连驻地都分开了。
在宇智波富岳亮出万花筒写轮眼也没有阻止鼬的行动，鼬同样亮出了自己的万花筒写轮眼，当着所有的族人面，轻易的击败了宇智波富岳。
这段时间里忍者学校又多了一名叫空的家伙，实力也非常强劲，对方几个月前来到木叶，被暗部找上，不知道怎么就加入了木叶，也被安排在本届参加下忍毕业部考试。
还有五代火影纲手的小徒弟漩涡香磷，本届毕业的人一个个都是实力选手，了解的人都异常关注这届新人。
寿树也被纲手询问是否有意带队新人，寿树直接就拒绝了。
他这段时间没有暗中在做什么激烈的事情，只是散播出去了很多查克拉血继果实到忍界的各处，给你些有缘人机缘，也算是他在忍界的播种了。
他的主要注意力全都放在了忍界之外。
异星上的能量神树在再次升级之后展现出来了无与伦比的能量收集效率。
成长到万米高的巨树在巨大的星球上也清晰可见，就像一座巨大的山脉一样，其根须几乎遍布了整个星球。
十尾也被寿树送到了那里，重新变化为神树，第二个查克拉果实已经在酝酿之中了，有着一整个星球能量的支撑，相信很快就能再次成熟。
忍界星球所在的星系寿树也探查完毕了，除了离太阳太近的那一颗，其它几颗都不太适合种植神树，不是巨型的气态行星，就完全是一个冰疙瘩的那种。
没有暗中动手，不代表寿树对忍界现在的状况不了解。
晓组织集体跑路，现在藏身于一个小国地下，正在疯狂利用外道魔像生产白绝，已经积攒了不少数量了。
晓组织其它人也在暗中调查着剩余尾兽的踪迹，尤其是蝎到处寻找着大蛇丸的痕迹。
八尾在长门回来后就发现是假的了，八尾还在云忍手中，九尾在木叶被严加看管，五尾在岩忍。
只有一尾在在大蛇丸一个人的手里，所以他们的人在疯狂追杀大蛇丸这个叛徒。
寿树也给了大蛇丸一些协助，我爱罗被大蛇丸这个家伙带着精神都好了很多。
大蛇丸给我爱罗尾兽封印打了不少补丁，暂时隔绝了一尾的影响，让我爱罗异常亲近大蛇丸。
当初逃跑的志村团藏现在也在大蛇丸的手上，那双异常觉醒的万花筒写轮眼，他已经研究了很久了，那种能够逆转时间做到复活的瞳术让大蛇丸如获至宝。
志村团藏的价值被大蛇丸完全榨了个干净，现在被做成了傀儡准备在之后的大战中使用，傀儡的技术还是从写那里偷来的。
死了再用秽土转生拉起来继续发光发热。
晓组织寿树已然准备留给鸣人和佐助去解决了，他暂时不准备插手六道仙人的家庭剧。
很快毕业考试就结束了，纲手可是为这届毕业的下忍分配队伍头疼了一阵，尤其是寿树不干后，漩涡鸣人让谁带领是个巨大的麻烦。
最后这件差事还是落到了卡卡西头上，谁让他是四代火影的徒弟呢，纲手找到他，他于情于理都没法拒绝。
第七班就这样再次出现了，依然是鸣人佐助和小樱，本来纲手是准备让香磷加入的，但香磷死活不同意。
她和鸣人在学校时矛盾非常大，两人都互相看不顺眼。
最后香磷和空与另一名忍者组成了一小队，由静音负责带领，静音知道这个消息时差点去跳楼，她已经够忙了，还要带一队下忍。
但最终在香磷星星眼的攻势下还有纲手大人的强硬要求最后答应了。
在忍界紧张的局势下，新一届的下忍小队开始了他们的下忍生涯，在队长的带领下开始接取任务。
忍界一切好像又走上了原本的轨迹，但很多东西又都变了样子。
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